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用AnnoLnc来辅助lncRNA研究

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发表于 2017-3-1 16:48:47 | 显示全部楼层 |阅读模式
网页工具真心没什么好讲的,自己去摸索:http://annolnc.cbi.pku.edu.cn
微信公众号"小张聊科研"有一篇介绍AnnoLnc的文章,点击这里查看。

北京大学蛋白质与植物基因研究国家重点实验室高歌研究员领衔的团队在《BMC Genomics》发表在线工具"AnnoLnc",利用该工具可以系统性注释新的人类lncRNA。

一个系统地注释新的人类lncRNA的一站式网站。该工具基于700多个数据资源和各种工具链,AnnoLnc的系统性注释涵盖了基因组位置,二级结构,表达模式,转录调控,miRNA相互作用,蛋白质相互作用,遗传关联和进化。该网站具有直观的Web界面,可用于通过桌面和移动设备进行交互式分析,程序员可以通过标准的基于JSON的Web服务APIs进一步将AnnoLnc集成到他们的分析流程中。

结论:AnnoLnc是唯一的网络服务器,为确定人类新的lncRNA提供即时和系统的注释。与类似的工具相比,AnnoLnc生成的注释覆盖范围更加广谱性并且更加直观的可视化。案例研究表明AnnoLnc威力不仅在重新发现人类lncRNA的已知功能,而且启发检索人员提出新假设。





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