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HPO数据库下载并且解析

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发表于 2017-3-2 15:12:06 | 显示全部楼层 |阅读模式
也是一种ontology的数据:
文献是:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2668030/
官网是:http://human-phenotype-ontology.github.io/documentation.html
可以在官网下载所有的数据:
http://purl.obolibrary.org/obo/hp.obo
http://purl.obolibrary.org/obo/hp.owl
还有enes_to_phenotype.txt and phenotype_to_genes.txt),一个月更新一次
有人做了一个可视化网页来显示这些term,https://mseqdr.org/hpo_browser.php?118;
一篇文献:Indexing(rare(diseases(with(HPO(terms a(new(Orphanet((service(to(refine(phenotype:genotype(cor: relations
http://phenoday2015.bio-lark.org/pdf/10.pdf

最新的文献:http://www.cell.com/ajhg/pdf/S0002-9297(15)00234-7.pd



上一篇:OMIN数据库里面跟cancer相关的条目
下一篇:在R里面把变量write.table之后竟然不一定能read.table
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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