多个芯片数据整合分析-跨平台！

Jimmy

我不推荐这样做，但是总是有人问这个问题，我就给个例子吧，反正就是纯粹的灌水而已！
这篇文章：http://diagnosticpathology.biome ... 6/s13000-016-0596-x
A transcriptome profile in hepatocellular carcinomas based on integrated analysis of microarray studies
整合了7个芯片数据，如下：
没什么特殊的统计方法：
We selected the Z-score transformation method to normalize raw data from different platforms.

参考的是：Yang Z, Chen Y, Fu Y, Yang Y, Zhang Y, Li D. Meta-analysis of differentially expressed genes in osteosarcoma based on gene expression data. BMC Med Genet. 2014;15:80. 里面的整合方法

果子

我觉得你就是神人，无处不在，感谢分享，常来玩哦

朝曦曦

请问这篇文章脚本或者类似的脚本哪里可以找到吗？

tommyhechina

这个灌得太过分了。我看了下文章，直接就把各个平台的芯片数据挑出自己需要的部分，强行整合到一起进行分析。且不说整合不同芯片需要考虑批次效应，而且不同平台的并不能放在一起同时分析。