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percentile rank百分比排名,也可以用来定量基因表达量

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发表于 2017-3-4 12:53:08 | 显示全部楼层 |阅读模式
百分比排名(percentile ranking):


求某个数据的百分比排名,即是求比此数据小的数据个数除以与此数据进行比较的数据个数总数。这个在分数上经常用到,比如说一个人考试分数为85分,percentile ranking是95%,意思是把他的成绩与其他所有参加考试的的人的成绩比较,他的成绩比95%的人的成绩要高。

percentile ranking显示的是一个人成绩与其他人的比较情况,并不代表具体分数。所以我们通常会用百分比来排名,这更加的简便,而且十分易观。

如果我们下载TCGA的表达矩阵,发现它对基因的表达量做两个transformation,就需要理解,那已经不是纯粹的表达量了。


百分比排名究竟有何作用呢?为什么不直接计算排名,用排名来看不是更加直观吗?从单个数据表来看,可能百分比排名并不显出其价值来.

但如果要求比较在不同数据表中的两个数据谁高谁低,用其直接的在其各自的数据表中的高低排名来比较,就显得不是很科学,

参考:https://en.wikipedia.org/wiki/Percentile_rank



上一篇:数据测量水平(Measurement Level)可以分为四类
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发表于 2017-3-4 16:45:59 | 显示全部楼层
percentile ranking确实比较直观,比如说在比较同一个基因的不同转录本的表达量的时候。但是群主最后一句话很有意思,这里我有个问题:如何综合排名一个基因在不同时间点样品中的不同转录本丰度?
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