limma包中mode.matrix(~0+factor(group))的问题

zhuangrui_tea

limma包中design<- mode.matrix(~0+factor(group))

用来定义分组矩阵，当实验分组为con,terat1,treat2...treat10,时，"treat"的名字为xxx_xxx_xxx格式时（为了自己看的明白），使用mode.matrix()，会自动根据字母和数据的顺序重新排序，与表达矩阵排序就不一致，此时应如何解决呢？不进行自动排序，而是按照我的自定义的顺序设计分组矩阵。（可以通过其他命名方法来避免自动排序带来的问题，但那样对样本的描述就不准确）
谢谢！
例如，我希望的顺序是
c("mucosa_0hr","skin_0hr","mucosa_6hrs","skin_6hrs","mucosa_12hrs","skin_12hrs","mucosa_24hrs","skin_24hrs","mucosa_3days","skin_3days","mucosa_5days","skin_5days","mucosa_7days","skin_7days","mucosa_10days","skin_10days")

但实际输入后的排序如下图所示
输入：

被自动排序：