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发表于 2017-3-8 15:47:24 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 ydchen 于 2017-3-8 15:49 编辑
为了应对测序价格迅速走低带来的竞争,并适应精准医疗带来的巨大市场需求,Affymetrix于2016年推出了名为“精准医疗研究芯片”(PrecisionMedicine Research Array,PMRA)的SNP芯片。



必须要提到的是,PMRA最大的特点就是:便宜!
除了价钱便宜,量也是足的。Affymetrix官方是这样描述这款新产品的:

(1) PMRA提供了来自最新的1000Genome PhaseIII和更新至2016年5月份的NHGRI-EBIGWAS catalog数据库中的内容,为关联分析提供更精准的标记;
(2) 囊括已经临床验证的致病位点;
(3) 覆盖来自GWAS研究的癌症相关常见变异(commonvariants);
(4) 覆盖了免疫和转移相关的变异,包括HLA和KIR相关的marker,并可使用AxiomHLA分型软件进行HLA分型;
(5) 包括了血细胞表型相关的marker,和血液病学GWAS研究中得到的结果;
(6) 与其它分型平台共享了一些fingerprintSNPs,可用于追踪样本。




作为一款高密度SNP芯片,SNP标记平均覆盖了全基因组,可保证PMRA满足全基因组关联分析和遗传连锁分析的需要。另外,PMRA囊括了最新GWAScatalog数据库中的SNP位点,这对关联分析检测效力的提升是可想而知的。最后,看名字就能知道,PMRA芯片在临床研究上的应用也不可小觑。由于体现了几乎最新的临床研究成果,PMRA可担任起易感位点检测和基因分型的任务,提供用药和治疗方案上的指导。



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