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关于ped和map文件

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发表于 2017-3-9 21:35:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
如题,有没有谁了解ped和map文件,我怎么得到这两个文件,是从我的vcf文件里吗?可否有详细的说明,谢谢
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发表于 2017-3-10 09:34:39 | 显示全部楼层
you should search them by google, it's not wise to ask here .
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 楼主| 发表于 2017-3-10 13:23:41 | 显示全部楼层
为什么。。英文的实在看得不理解,有没有中文解释的。。
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发表于 2017-3-14 12:26:48 | 显示全部楼层
安装plink 1.09,可以将VCF文件转成ped和map: plink --noweb --vcf file.vcf --reocde --out  file
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发表于 2017-3-14 16:56:06 | 显示全部楼层
推荐使用Plink 1.9,速度和稳定性上有一定的提升,在1.9里面已经抛弃了 --noweb的参数。
plink --vcf file.vcf --recode --out file
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发表于 2017-3-14 20:31:05 | 显示全部楼层
hyacz 发表于 2017-3-14 16:56
推荐使用Plink 1.9,速度和稳定性上有一定的提升,在1.9里面已经抛弃了 --noweb的参数。
plink --vcf file. ...

plink1.09用的不多
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