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上下调基因数目为什么会相近?

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发表于 2017-3-10 10:39:48 | 显示全部楼层 |阅读模式
答:可以从2个维度解释:
一般情况下,我们会假设细胞的代谢活性是相同的,mRNA总量也是相同的,既然总量相同,有基因下调理论上就应该对应有基因上调。所以上调基因数量与下调基因数量我们期望是基本相同的,不会差太远。
另一方面的解释,大部分基因是在代谢通路里面,代谢通路里面基因是层层相扣的,有正调控就会有负调控,这个基因的上调可能会导致下游的基因下调,即应该有一个正负反馈的调控关系。因此一般情况下我们会认为上下调的基因数不会差太远。

一般情况是如此,但是也不排除一些特殊处理:比如癌细胞与正常细胞,比如病毒侵染,那些受到很强的化学刺激处理的样本在上下调基因数基本一致的假设是不成立的,因为应激太剧烈,人的细胞会产生大量的炎症反应,可能会存在大量的基因上调。只能说一般情况下温和的处理上下调基因数是一致的,不会差太多,起码都是在一个数量级以内。



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