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17个基因可预测AML患者的生存

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发表于 2017-3-10 10:41:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
多伦多大学领导的一个国际研究小组发现,来自白血病干细胞的17个基因的标签,可以预测急性骨髓性白血病(AML)患者对治疗的响应情况。他们分析了78名AML患者样本中白血病干细胞和非白血病干细胞之间的基因表达差异,找到了17个差异表达的核心基因。这组基因的评分高与不良预后相关,可以用来识别不能从标准治疗中受益的患者。相关研究结果发表在《Nature》上。

文章作者Jean Wang说,“不论AML患者在哪里进行治疗,这组基因都可以用来预测他们的生存。利用该17个基因的评分,我们也可以快速评估新诊断的AML患者的风险。”


基于干细胞的17-基因评分与AML患者的生存相关

Wang等人从78名AML患者中分选了83个细胞样本,评估这些细胞组分的白血病干细胞活性。通过比较白血病干细胞和非白血病干细胞之间的基因表达,研究人员找到了100多个基因,它们在两种细胞之间的表达差异超过2倍。

利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中495名患者的数据集——该数据集含有研究者所选104个基因中的89个,研究人员试图找到核心的一组基因,使用统计回归算法,他们获得了一个17个基因的标签,并称之为LSC17。

通过计算这17个基因表达的加权和,研究者发现,较高的LSC17评分与总生存期(overall survival)和无事件生存期(event-free survival)较低相关。在诊断时,评分高的患者具有更高的骨髓原始细胞百分比,更高的FLT3内部串联重复突变发生率,不利的细胞遗传学特征,以及高复发率和对化疗的反应率较低。

研究人员随后在3个独立的AML队列中证实了LSC17评分与生存之间的关联。


LSC17评分可以广泛地用于AML患者的临床预后

为了将该基因评分用于临床,研究者们将它整合到定制的NanoString分析中。他们在来自玛格丽特公主癌症中心(PrincessMargaret Cancer Centre)的307名AML患者中测试了该定制的检测。结果发现,与较低评分相比,较高的LSC17评分与不良预后、较短的总生存期,以及较短的无事件生存期和无进展生存期(progression-free survival)相关。

研究人员指出,即使是对细胞遗传学特征正常的AML患者,LSC17评分在多变量生存分析中也具有预测价值。这表明基于NanoString分析的评分具有广泛的适用性和强有力的预后价值。

对于接受异体干细胞移植(aSCT)的患者,LSC17评分高也与较差的预后相关。由于aSCT治疗的死亡风险,这种治疗通常只用于复发风险高的患者。研究人员建议将LSC17评分用于判断哪些患者可以接受aSCT治疗。

另外,研究者还发现,在玛格丽特公主癌症中心的患者队列中,LSC17评分还可以预测新诊断患者的治疗抵抗性。他们进一步分析了ALFA-0701试验的数据,发现LSC17评分低的患者可以从标准化疗联合吉妥单抗(gemtuzumab ozogamicin,GO)治疗中受益。LSC17评分可用于识别从这种治疗中获益的患者。

Wang说,“LSC17评分是目前可用于AML的最强大的预测和预后生物学标志物,也是用于人类癌症的第一个基于干细胞的生物标志物。临床医生可以使用该工具分析AML患者的风险,进行个性化治疗。”

参考文献:A 17-gene stemness score for rapid determination of risk in acute leukaemia. Nature (2016)doi:10.1038/nature20598



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