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Genomic region black lists 这个概念很重要

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发表于 2017-3-13 11:28:02 | 显示全部楼层 |阅读模式
虽然只是一个简单的文件,http://hgdownload.cse.ucsc.edu/g ... usExcludable.bed.gz
就是以BED格式记录的一些基因组上面的坐标,
主要是重复区域,端粒,中心粒,等各种很麻烦的位置。
不管是在上面找到的变异位点,还是蛋白结合位点, 都不是很准确,需要注意一下。



上一篇:ENCODE计划中的TF的ChIP-seq结果的motif展示
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你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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发表于 2017-3-27 09:39:01 | 显示全部楼层
楼主,能来个实例讲讲么,基本概念这东西看多了,是具有基础了,但是离实际操作还是很远的。谢谢楼主
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发表于 2017-8-18 16:37:54 | 显示全部楼层
补充 blacklist 项目的 官网
https://sites.google.com/site/anshulkundaje/projects/blacklists

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