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转录复合体(transcription complex)的四个重要“原件

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发表于 2017-3-14 09:32:07 | 显示全部楼层 |阅读模式
转录复合物有4个重要的部分:

1 RNA pol II RNA聚合酶II。
所有的基因和大部分ncRNA都是这种聚合酶转录的。ChiP的阳性内参就是这个加DNA结合区域。


2 TF 转录因子。
重要的转录控件。具有组合效应。模型很像布尔代数。


3 修饰的组蛋白:
修饰/未修饰就是开关


组蛋白是存在于染色体内的与DNA结合的碱性蛋白质。组蛋白于1834年由德国科学家A.科塞尔发现。组蛋白对染色体的结构起重要的作用。染色体是由重复单位──核小体组成。每一核小体包括一个核心8聚体(由4种核心组蛋白H2A、H2B、H3和H4的各两个单体组成);长度约为200个碱基对的脱氧核糖核酸(DNA);和一个单体组蛋白H1。长度为147碱基对的DNA盘绕于核心8聚体外面。在核心8聚体之间则由长度约为60个碱基对的DNA连接。这种DNA称为“接头”DNA。

------------修饰组蛋白命名规则
H3K4me3
1 H3 表示下图左下的单体蛋白。
2 K4 表示第4位的赖氨酸,K是赖氨酸的缩写表示。
3 me3 表示3个甲基化修饰
------------
P  表示磷酸化
Ac 表示乙酰化
Ub 表示泛素化
。。。。

通常含有H1,H2A,H2B,H3,H4等5种成分。除H1外,其他4种组蛋白均分别以二聚体(共八聚体)相结合,形成核小体核心。DNA便缠绕在核小体的核心上。而H1则与核小体间的DNA结合。因此,一般认为组蛋白作为结构支持体的作用比其基因调节作用更为重要。鸟类、两栖类等含有细胞核的红细胞中,含有一种叫H5的特殊组蛋白。此外,在停止增殖的细胞中,还含有一种叫H1°的组蛋白,H1°的结构与H5相类似。

组蛋白可受到甲基化、乙酰化、磷酸化、聚ADP核糖酰化,以及与泛醌(ubiquinone)相结合等几种类型的修饰。组蛋白的修饰与染色质结构的变化及基因活性控制的相关性等等,和各种重要的生命过程有关:




4 重要的Med
中介体,转录复合体的重要负控因子。
看看Cell 2011给这种重要蛋白的比喻:就是“转录调控的接力棒”。



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