在线基因芯片meta分析——Oncomine在线实现

medical

随着测序技术的发展，近年来产生了大量的测序数据，如何有效利用这些数据，发掘癌症潜在的发病机制及药物靶点等是摆在临床医生、基础科学家面前的重要任务，Oncomine是目前最大的癌症基因芯片数据库，具有潜在的巨大利用价值，下面简单介绍Oncomine的在线基因芯片meta分析，主要以截图形式展现，欢迎有经验的朋友不断补充。1、主页面介绍及登录框（注册很讲究，要用非营业性邮箱注册）网址：https://www.oncomine.org/resource/login.html



2、左上角搜索框（可以输入单个基因或肿瘤）及左侧的目录（目录主要为各种filter，即分析条件，只需要根据你的需要选择就可以了）
里面你看到了，有共表达分析、差异分析及Oncomine自身开发的outlier分析（主要发现可能遗漏的一些重要基因）


3、有各种analysis type，dataset type 等

4、可以选择一种肿瘤，也可以分析某些基因在多种肿瘤中表达情况。

5、可以选择样本类型如肿瘤位点相关的、与生存结局有关的、耐药有关的等等，还可以选择样本量大小、不同的分析平台，
多方向分析！超级强悍！


6、结果展示、结果可视化。


本文由生信技能树会员medical撰写，转载请声明来源生信技能树。