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在线基因芯片meta分析——Oncomine在线实现

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发表于 2017-3-25 00:36:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
随着测序技术的发展,近年来产生了大量的测序数据,如何有效利用这些数据,发掘癌症潜在的发病机制及药物靶点等是摆在临床医生、基础科学家面前的重要任务,Oncomine是目前最大的癌症基因芯片数据库,具有潜在的巨大利用价值,下面简单介绍Oncomine的在线基因芯片meta分析,主要以截图形式展现,欢迎有经验的朋友不断补充。1、主页面介绍及登录框(注册很讲究,要用非营业性邮箱注册)网址:https://www.oncomine.org/resource/login.html



2、左上角搜索框(可以输入单个基因或肿瘤)及左侧的目录(目录主要为各种filter,即分析条件,只需要根据你的需要选择就可以了)
里面你看到了,有共表达分析、差异分析及Oncomine自身开发的outlier分析(主要发现可能遗漏的一些重要基因)


3、有各种analysis type,dataset type 等

4、可以选择一种肿瘤,也可以分析某些基因在多种肿瘤中表达情况。

5、可以选择样本类型如肿瘤位点相关的、与生存结局有关的、耐药有关的等等,还可以选择样本量大小、不同的分析平台,
多方向分析!超级强悍!


6、结果展示、结果可视化。


本文由生信技能树会员medical撰写,转载请声明来源生信技能树。

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