甲基化分析-求助帖

zyworship · 发表于 2017-3-28 11:43:55

最近在分析甲基化数据，已经进行了Bismark的map，和extract，但是在使用methylKit分析随后，首先使用methylKit读了Bismark生成的sam文件，然后做了methylation level图，发现和公司已经给的图结果不太一样，想问一下，公司给做的这个图是怎么做出来的？同时methylKit，作图的时候，好像可以控制的参数比较少。想问一下，小提琴图怎么做？

Alex · 发表于 2017-3-28 16:17:59

采用vioplot（）或者ggplot2R包，你去搜下就好

zyworship · 发表于 2017-3-29 17:37:24

Alex 发表于 2017-3-28 16:17
采用vioplot（）或者ggplot2R包，你去搜下就好

兄台可否是做甲基化的，关键我不知道做vioplot（）作图，用哪些数据集呢

Alex · 发表于 2017-3-29 23:01:54

我不做甲基化，我只画图

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