最好用的TCGA可视化数据库GEPIA

果子

20170406更新：
直接在生信技能树的公众号写了个帖子
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz ... MxAVPxNahR9MsGrj#rd
直接看看吧。

我说他最好用，你可能会不服气
我说他是中国人做的，你可能还不相信，但是确实就是这样。
http://gepia.cancer-pku.cn/index.html

这个数据库可以分析有什么功能呢？
给一个基因，告诉你在所有肿瘤组织里面的表达情况，同时还展示其在癌和癌旁的表达
给一个基因，自动做生存分析
你给一个癌症，他告诉你所有跟生存分析最相关的基因，这一点就很碉堡了好么？！
给一个基因，告诉你他的共表达基因，或者叫表达模式相似的基因
给两个基因，告诉你他在特定组织的相关性
可以做编码基因，也可以做非编码基因
但是我不会演示怎么做，为什么呢
两个原因
1.产品好到一定程度是不需要教程的，你一看就知道怎么用
2.你知道这个数据库做什么的就行了，如果你有需求你会点开的，你一点开就满足了条件一
这个数据库满足了我对TCGA所有的分析
差异分析
生存分析
共表达分析
够了，我最喜欢！！他一出现，你就再也回不去了！！

Jimmy

Copyright © 2017 Zefang Tang, Chenwei Li, Boxi Kang. Zhang's Lab. All Rights Reserved.
原来如此呀~

果子

Jimmy 发表于 2017-4-3 16:46
Copyright © 2017 Zefang Tang, Chenwei Li, Boxi Kang. Zhang's Lab. All Rights Reserved.
原来如此呀~ ...

我也是偷听你们谈话才知道的，胡博强的师弟嘛！

madala

无意中又发现一个神器 码了