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最好用的TCGA可视化数据库GEPIA

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发表于 2017-4-3 16:16:37 | 显示全部楼层 |阅读模式
20170406更新:
直接在生信技能树的公众号写了个帖子
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz ... MxAVPxNahR9MsGrj#rd
直接看看吧。

我说他最好用,你可能会不服气
我说他是中国人做的,你可能还不相信,但是确实就是这样。
http://gepia.cancer-pku.cn/index.html

这个数据库可以分析有什么功能呢?
给一个基因,告诉你在所有肿瘤组织里面的表达情况,同时还展示其在癌和癌旁的表达
给一个基因,自动做生存分析
你给一个癌症,他告诉你所有跟生存分析最相关的基因,这一点就很碉堡了好么?!
给一个基因,告诉你他的共表达基因,或者叫表达模式相似的基因
给两个基因,告诉你他在特定组织的相关性
可以做编码基因,也可以做非编码基因
但是我不会演示怎么做,为什么呢
两个原因
1.产品好到一定程度是不需要教程的,你一看就知道怎么用
2.你知道这个数据库做什么的就行了,如果你有需求你会点开的,你一点开就满足了条件一
这个数据库满足了我对TCGA所有的分析
差异分析
生存分析
共表达分析
够了,我最喜欢!!他一出现,你就再也回不去了!!

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发表于 2017-4-3 16:46:13 | 显示全部楼层
Copyright © 2017 Zefang Tang, Chenwei Li, Boxi Kang. Zhang's Lab. All Rights Reserved.
原来如此呀~
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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 楼主| 发表于 2017-4-3 16:58:31 | 显示全部楼层
Jimmy 发表于 2017-4-3 16:46
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原来如此呀~ ...

我也是偷听你们谈话才知道的,胡博强的师弟嘛!
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发表于 2018-7-25 19:46:50 | 显示全部楼层
无意中又发现一个神器 码了
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