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R语言做coxPH建立生存对象Surv和右删失censoring的问题

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发表于 2017-4-9 22:45:52 | 显示全部楼层 |阅读模式
假设我的数据集为2013-2015年每年7月加入一批随访的患者,至今仍在继续收集数据。第一个问题:如果我想研究随访患者在随访第一年内的生存率, 那么用Surv创建生存数据的对象的时候生存时间是算 (1) 认为研究终止与当下,计算时至今日(2017年4月)的存活时间;还是(2)每个个体活到第一年的时间?(例如2013年的个体就看365天内的存活,即至2014年7月,能够活到一年的存活时间为365且标记为删失,死亡时间未发生?),其他年份以此类推(2014年7月的新加入的患者看有没有活到2015年7月之类)?那如果我想设定研究时间是2013年至今而不是一年呢?

第二个问题可能比较冷门,患者的失去跟踪也就是删失/截尾的比例较高,而且我有较大的信心认为失去跟踪很有可能是患者已经死亡。这种情况好像是所谓的“informative censoring”,应该如何纠正这个偏差?
生信小白求轻拍~万分感谢。






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 楼主| 发表于 2017-4-11 04:44:34 | 显示全部楼层
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