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[其他] blast 结果文件 相似性 数值化

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新手上路

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发表于 2017-4-13 15:13:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
如图,这是截取的基因组(11:68171665-68171909)上的序列进行blast之后的结果,其中最上面的为比对到基因组上自身的结果,其它为比对到非自身的结果,对于比对到非自身的结果应该怎么计算截取的序列与比对到非自身的基因组序列之间的的相似性?(是 第四列数据×第三列数据÷截取的长度÷100 ,还是 第四列数据×(第八列数据-第七列数据+1)÷截取的长度÷100 , 还是其它的计算方法呢?)期待大神指点!先谢谢了!

这是blast结果文件

这是blast结果文件
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