Starbase是做lncRNA/circRNA/microRNA的综合性数据库

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Starbase（http://starbase.sysu.edu.cn/index.php）-中山大学


Starbase是做lncRNA/circRNA/microRNA等研究常用的强大数据库，Starbase可以帮我们解决这些问题：
一、根据microRNA找非编码RNA（比如lncRNA，circRNA等）
二、根据microRNA找mRNA靶点；
三、查找ceRNA调控分子；
四、查找RNA的结合蛋白；



Starbase数据库于2011年上线，2014年更新到了2.0版本，开发者是中山大学RNA信息中心的屈良鹄研究团队。

屈良鹄教授是生命科学学院教授、博士生导师，国家杰出青年基金获得者，教育部“长江学者奖励计划”特聘教授。长期从事分子生物学与基因工程方面的教学与科学研究，是RNA组学领域专家。他先后主持国家自然科学基金重点项目、国家科技部“973”重要科学前沿项目以及中美和中法等国际合作等项目。在Nature、Science、PNAS、Hepatology、Nucleic Acids Res等国际重要杂志上发表论文100余篇，论文被引用2000余次、获国家发明专利5项。

使用Starbase数据库需要引用原文：
starBase v2.0: decoding miRNA-ceRNA, miRNA-ncRNA and protein-RNA interaction networks from large-scale CLIP-Seq data.
starBase: a database for exploring microRNA-mRNA interaction maps from Argonaute CLIP-Seq and Degradome-Seq data.

除了Starbase外，他们实验室还开发了：
DeepBase（从高通量测序数据中系统发掘多种小RNA的计算平台，Nucleic Acids Res. 2010，http://rna.sysu.edu.cn/deepBase/）；
miRExplorer（高通量发掘miRNA的可视化软件，RNA Biology 2011，http://biocenter.sysu.edu.cn/mir/.）等。

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