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用SNP4Disease来根据疾病查SNP位点

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发表于 2017-4-19 14:44:21 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 ydchen 于 2017-4-19 14:48 编辑

SNP4Disease: a knowledge database to detect disease associated SNPs
SNP与疾病相关数据库
链接:http://snp4disease.mpi-bn.mpg.de/
我们可以直接根据SNP或者疾病进行查询,比如我们需要查询糖尿病相关的SNP位点,就可以在Disease搜索框中输入Diabetes,会自动跳出选项

除了可以直接检索疾病或者基因外,我们还可以通过基因进行检索:

另外,如果我们关心两个疾病之间的关系,我们还可以查找两个疾病共同的SNP位点:


这个类型的数据库其实用处很大,可惜更新太慢了,
Last update:26.10.2012
Ressources of SNP4DiseaseRessourceDownloaded DateURL
dbSNPbiuld 137 (Okt. 2012)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/
PubMedOkt. 2012http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
OMIMOkt. 2012http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/OMIM/
MeSHOkt. 2012http://www.nlm.nih.gov/mesh
Entrez GeneOkt. 2012http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gene/
NHGRI GWAS CatalogOkt. 2012http://www.genome.gov/gwastudies/
业界基因检测肯定没办法用这么老旧的数据库,但是一般公司可以自己做出类似的数据库资源,就是需要花大力气来整理,校验




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