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[software] 用SomaticSignatures包来解析maf突变数据获得mutation signature

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发表于 2017-4-24 20:29:35 | 显示全部楼层 |阅读模式
拖延了很久,真的不应该。真的好好反省。希望不忘初心。
本来想翻译,翻译不好,大家好好看下面的链接,讲的很清楚,包括思想,流程
http://www.bioconductor.org/packages/3.3/bioc/vignettes/SomaticSignatures/inst/doc/SomaticSignatures-vignette.html


知道了这个以后看代码旧会理解很多,记得看大神给的文献哦。
http://www.bio-info-trainee.com/1623.html
大神写的很详细了。
一定要自己运行一遍,把它搞懂。
有问题一起讨论哦。

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 楼主| 发表于 2017-4-24 21:44:52 | 显示全部楼层
基序提取
构建矩阵
SomaticSignatures估计方法选择对其进行估计
体细胞突变在样本中分布的可视化
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