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楼主: Jimmy

详细讲解如何抽取fasta文件里面指定序列名的序列

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 楼主| 发表于 2017-2-22 09:33:04 | 显示全部楼层
W.Peng 发表于 2017-2-22 09:23
好贴,学习了两个新方法,biopython和samtools

为什么没有人觉得,学会了编程,更重要呢?
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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发表于 2017-2-22 09:38:14 | 显示全部楼层
Jimmy 发表于 2017-2-22 09:33
为什么没有人觉得,学会了编程,更重要呢?

当然学会了编程更重要,毕竟从原理上清楚了得到预期结果的过程细节。
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发表于 2017-3-11 20:56:48 | 显示全部楼层
设置了一个sign,太巧妙!
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 楼主| 发表于 2017-3-11 21:40:56 | 显示全部楼层
banapi 发表于 2017-3-11 20:56
设置了一个sign,太巧妙!

恭喜你,学到了我的编程思维
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发表于 2017-4-10 16:13:26 | 显示全部楼层
问题:如果文件几十个G,调取还是很慢,有没有办法解决
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 楼主| 发表于 2017-4-10 16:30:28 | 显示全部楼层
pele 发表于 2017-4-10 16:13
问题:如果文件几十个G,调取还是很慢,有没有办法解决

我不觉得慢,如果你想快,可以找一些发表的软件
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发表于 2017-4-10 16:51:15 | 显示全部楼层
我前几天用py写了个这样的脚本,从1000w行中帅选2w行,真的是慢的要死要死的,有没有好方法
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 楼主| 发表于 2017-4-10 16:53:49 | 显示全部楼层
pele 发表于 2017-4-10 16:51
我前几天用py写了个这样的脚本,从1000w行中帅选2w行,真的是慢的要死要死的,有没有好方法 ...

你脚本写的不好吧,我写的挺快的
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发表于 2017-4-10 18:50:04 | 显示全部楼层
一万点伤害
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发表于 2017-7-14 14:54:41 | 显示全部楼层
受益匪浅,现在还处在写最基础最简单还不简便的正规代码中!!!!
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