【明概念】微生物组（microbiome）

Panda姐

写在前面
      人体微生物组研究计划：美国人体微生物组计划，加拿大微生物组研究项目，人类肠道宏基因组计划MetaHIT（欧盟和中国参与）以及日本的人体元基因组研究计划。此外，还有地球环境微生物组计划EMP，全球海洋采样考察GOS。今年五月份，美国还启动了“国家微生物组计划”（National Microbiome Initiative, NMI），旨在推动微生物科学的发展，使个体、社区乃至全人类在卫生保健、食品生产和环境恢复等领域受益。
   也许大家跟我一样知道到微生物组这个名词是从以上那些重大微生物组研究计划了解到的。如果真的要来个名词解释说说，还真不知道微生物组的概念，是生态学概念（许多微生物群落的集合），还是像蛋白质组、基因组那样的组学概念（一个微生物群体的全部基因组的集合）。那么大家就跟我一起来学习一下吧！
         
微生物组到底是什么意思？
## 别人说：微生物存在于人体、植物、土壤、海洋等各种环境中，这些微生物群落的集合被称为微生物组。来自NMI计划的美国白宫发文。

## 别人说：What does the term microbiome mean? And where did it come from? A bit of a surprise ..这位作者很严谨，追溯了很多文献和资料。


## 别人说：这个似乎最靠谱。但是在该篇综述中的定义。
a | Microbiota: 16S rRNA surveys are used to taxonomically identify the microorganisms in the environment.
b | Metagenome: the genes and genomes of the microbiota, including plasmids, highlighting the genetic potential of the population.
c | Microbiome: the genes and genomes of the microbiota, as well as the products of the microbiota and the host environment. Abbreviation: rRNA, ribosomal RNA.

Figure 1: Definition of the microbiota, metagenome and microbiome as used in this Review.

bioinfo何婷

基础不牢 地动山摇 好像是从博主那学来的话