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[其他] 求助:alpha多样性分析之前数据拉平处理

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发表于 2017-6-6 14:37:15 | 显示全部楼层 |阅读模式
就是我们在做alpha多样性之前,需要对otu表根据最低测序深度进行随机重抽样,即拉平处理,我知道qiime中的parallel_multiple_rarefactions.py可以实现otu矩阵稀疏化,并会输出好几个稀疏化的文件,之后我看别人说的是用R软件取均值即可,想问问这个取均值应该怎么理解啊,就是取重复出现的otu么? 可以用哪个包来处理?
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