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发表于 2017-6-7 08:27:28 | 显示全部楼层 |阅读模式


checkTCGA("DataSets", "LUAD")

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1  LUAD-FFPE.Merge_methylation__humanmethylation450__jhu_usc_edu__Level_3__within_bioassay_data_set_function__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
2                   LUAD-FFPE.Merge_mirnaseq__illuminahiseq_mirnaseq__bcgsc_ca__Level_3__miR_gene_expression__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
3                LUAD-FFPE.Merge_mirnaseq__illuminahiseq_mirnaseq__bcgsc_ca__Level_3__miR_isoform_expression__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
4                         LUAD-FFPE.Merge_snp__genome_wide_snp_6__broad_mit_edu__Level_3__segmented_scna_hg18__seg.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
5                         LUAD-FFPE.Merge_snp__genome_wide_snp_6__broad_mit_edu__Level_3__segmented_scna_hg19__seg.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
6      LUAD-FFPE.Merge_snp__genome_wide_snp_6__broad_mit_edu__Level_3__segmented_scna_minus_germline_cnv_hg18__seg.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
7      LUAD-FFPE.Merge_snp__genome_wide_snp_6__broad_mit_edu__Level_3__segmented_scna_minus_germline_cnv_hg19__seg.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
8                                                                                 LUAD-FFPE.Methylation_Preprocess.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
9                                                                               LUAD-FFPE.miRseq_Mature_Preprocess.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
10                                                                                     LUAD-FFPE.miRseq_Preprocess.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
11                                                                                        LUAD.Clinical_Pick_Tier1.Level_4.2016012800.0.0.tar.gz
12                                                                                             LUAD.Merge_Clinical.Level_1.2016012800.0.0.tar.gz
13                              LUAD.Merge_cna__illuminahiseq_dnaseqc__hms_harvard_edu__Level_3__segmentation__seg.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
14       LUAD.Merge_methylation__humanmethylation27__jhu_usc_edu__Level_3__within_bioassay_data_set_function__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
15      LUAD.Merge_methylation__humanmethylation450__jhu_usc_edu__Level_3__within_bioassay_data_set_function__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
16                          LUAD.Merge_mirnaseq__illuminaga_mirnaseq__bcgsc_ca__Level_3__miR_gene_expression__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
17                       LUAD.Merge_mirnaseq__illuminaga_mirnaseq__bcgsc_ca__Level_3__miR_isoform_expression__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
18                       LUAD.Merge_mirnaseq__illuminahiseq_mirnaseq__bcgsc_ca__Level_3__miR_gene_expression__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
19                    LUAD.Merge_mirnaseq__illuminahiseq_mirnaseq__bcgsc_ca__Level_3__miR_isoform_expression__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
20                     LUAD.Merge_protein_exp__mda_rppa_core__mdanderson_org__Level_3__protein_normalization__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
21                                LUAD.Merge_rnaseq__illuminahiseq_rnaseq__unc_edu__Level_3__exon_expression__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
22                                LUAD.Merge_rnaseq__illuminahiseq_rnaseq__unc_edu__Level_3__gene_expression__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
23                     LUAD.Merge_rnaseq__illuminahiseq_rnaseq__unc_edu__Level_3__splice_junction_expression__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
24                                 LUAD.Merge_rnaseqv2__illuminahiseq_rnaseqv2__unc_edu__Level_3__RSEM_genes__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
25                      LUAD.Merge_rnaseqv2__illuminahiseq_rnaseqv2__unc_edu__Level_3__RSEM_genes_normalized__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
26                              LUAD.Merge_rnaseqv2__illuminahiseq_rnaseqv2__unc_edu__Level_3__RSEM_isoforms__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
27                   LUAD.Merge_rnaseqv2__illuminahiseq_rnaseqv2__unc_edu__Level_3__RSEM_isoforms_normalized__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
28                        LUAD.Merge_rnaseqv2__illuminahiseq_rnaseqv2__unc_edu__Level_3__exon_quantification__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
29                    LUAD.Merge_rnaseqv2__illuminahiseq_rnaseqv2__unc_edu__Level_3__junction_quantification__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
30                             LUAD.Merge_snp__genome_wide_snp_6__broad_mit_edu__Level_3__segmented_scna_hg18__seg.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
31                             LUAD.Merge_snp__genome_wide_snp_6__broad_mit_edu__Level_3__segmented_scna_hg19__seg.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
32          LUAD.Merge_snp__genome_wide_snp_6__broad_mit_edu__Level_3__segmented_scna_minus_germline_cnv_hg18__seg.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
33          LUAD.Merge_snp__genome_wide_snp_6__broad_mit_edu__Level_3__segmented_scna_minus_germline_cnv_hg19__seg.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
34       LUAD.Merge_transcriptome__agilentg4502a_07_3__unc_edu__Level_3__unc_lowess_normalization_gene_level__data.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
35                                                                                     LUAD.Methylation_Preprocess.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
36                                                                                    LUAD.Mutation_Packager_Calls.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
37                                                                                 LUAD.Mutation_Packager_Coverage.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
38                                                                          LUAD.Mutation_Packager_Oncotated_Calls.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
39                                                                      LUAD.Mutation_Packager_Oncotated_Raw_Calls.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
40                                                                                LUAD.Mutation_Packager_Raw_Calls.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
41                                                                             LUAD.Mutation_Packager_Raw_Coverage.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
42                                                                                      LUAD.RPPA_AnnotateWithGene.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
43                                                                                     LUAD.mRNA_Preprocess_Median.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
44                                                                                         LUAD.mRNAseq_Preprocess.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
45                                                                                   LUAD.miRseq_Mature_Preprocess.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz
46                                                                                          LUAD.miRseq_Preprocess.Level_3.2016012800.0.0.tar.gz



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发表于 2017-6-7 17:38:56 | 显示全部楼层
发的什么鬼东西,代码高亮会不会呀,http://www.biotrainee.com/thread-16-1-1.html
你这个别人这么看
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