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这个数据集大家可能用得着-RNA-seq of 675 commonly used human cance...

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发表于 2017-6-8 10:37:29 | 显示全部楼层 |阅读模式
RNA-seq of 675 commonly used human cancer cell lines
https://www.ebi.ac.uk/arrayexpre ... -MTAB-2706/samples/

信息很全。

比如可以根据某个gene list把这其中的某个癌症细胞系分类:

Categorizing breast cancer cell lines into CT-High, CT-Int and CTLowgroups.
70 breast cancer cell lines are classified into three groups, CT-High, CTIntand CT-Low expressors by using first principal component values of 80 CT genes.

CT-PC1 values are the first principle component values which are calculated withprinciple component analysis.
Lower PC1 values indicate high levels of CT geneexpression in cell lines while cell lines which have low levels of CT gene expressionhave lower PC1 value.

Cut-offs to divide cells into groups was arbitrarily defined tocompose equal sample size in each




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 楼主| 发表于 2017-6-8 10:40:11 | 显示全部楼层
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