CCLE数据的可视化

Jimmy

CCLE就是Cancer Cell Line Encyclopedia，是一个药厂跟broad合起来做的，在2012年发了nature：https://www.nature.com/nature/jo ... ll/nature11003.html

数据非常多，但是一般人肯定只是想看不同的细胞系的基因表达。
两万多个基因在一千多个样本的表达矩阵文件有几百M，一般不需要下载，而且一般只关心几个自己感兴趣的基因在不同细胞系的表达水平


所以broad本身就提供了查询功能：
花一分钟注册一下就好了;https://portals.broadinstitute.org/ccle/search/searchResult
查询结果如下：



同时也会给mutation的信息，还有SNP6.0芯片测得的CNV信息。


还是很有用的