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[signal-pathway] 求助帖:Gene-act-network

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发表于 2017-6-26 19:25:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
求助帖:
#####一直疑问Gene-act-network和path-act-network如何做,或者用什么工具可以实现,用什么包可以做呢?
《Gene expression profiling of human bone marrow-
-derived mesenchymal stem cells during adipogenesis



这篇文章用芯片的处理后找到的差异基因做了go和KEGG富集

后面他们建立了Gene-act-network和patn-act-network网络图
都是有向图,都是基于KEGG数据库,我一直想实现,却不知道
到底怎么做,所以想求助大家能不能给个提示:

文章题目

文章题目


26Q32SO]TC`98@6[7KYDYJT.png

path-act-network
D0S3J9IW%$VHNRQ]RX10J3B.png

H(T]OENGU$L%4L_@N1(FCBJ.png
####Gene-act-network#####
8{2]I@%_1[WZC]F46ANQF]O.png
WOBB32MZ@L~8@OV@QN58U_T.png

希望能给个建议,谢谢!!!!



Rplot.png
Regression_lines.png
WOBB32MZ@L~8@OV@QN58U_T.png
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 楼主| 发表于 2017-6-26 19:41:31 | 显示全部楼层
声明一下:
不好意思,倒数第二个图我放错了,没有这个图,是我自己点错了,多放了一个图,请忽略
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发表于 2017-6-28 16:45:29 | 显示全部楼层
我的理解是path-act-network,应该是根据kegg上各个代谢通路的关系而做出来的一个图。gene-act应该也是类似的
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