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发表于 2017-6-28 21:16:50 | 显示全部楼层 |阅读模式

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 楼主| 发表于 2017-6-28 21:28:56 | 显示全部楼层
图片怎么上传不了,就是怎么用nmf分析96突变类型,并且和signature30进行聚类分析??
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发表于 2017-6-28 22:57:35 | 显示全部楼层
小江 发表于 2017-6-28 21:28
图片怎么上传不了,就是怎么用nmf分析96突变类型,并且和signature30进行聚类分析?? ...

不需要传图了,一个R包,http://www.bio-info-trainee.com/1623.html
用SomaticSignatures包来解析maf突变数据获得mutation signature
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 楼主| 发表于 2017-7-4 17:48:33 | 显示全部楼层
bioinfotrainee 发表于 2017-6-28 22:57
不需要传图了,一个R包,http://www.bio-info-trainee.com/1623.html
用SomaticSignatures包来解析maf突 ...

可是这个后面不能分析这个频谱和nature上的那个30个频谱哪些相似。
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发表于 2017-9-4 14:41:15 | 显示全部楼层
小江 发表于 2017-7-4 17:48
可是这个后面不能分析这个频谱和nature上的那个30个频谱哪些相似。

那就用另外一个R包,deconstructSigs R package
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