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【免疫组测序-1】免疫组测序背景介绍(免疫组库)

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发表于 2017-7-1 10:59:03 | 显示全部楼层 |阅读模式
       人体的适应性免疫系统(又称为获得性免疫或特异性免疫)是通过后天刺激而形成,能识别并清除多种病原体以保护组织正常,主要由B细胞和T细胞表面的抗原受体组成(BCR, TCR)。BCR和TCR都是由两条不同的链连接而成,BCR包含免疫球蛋白重链(immunoglobulin heavy chain)和轻链(light chain),TCR为α链和β链。

       人体内的BCR和TCR共同组成了免疫组库,在BCR的重链以及TCR的β链DNA序列中都是由V(viable)-D(diversity)-J(join)三部分组成,而轻链及α链则只有V和J两部分。V-D-J的随机重组;V-D,D-J连接区域的碱基随机插入删除;以及超突变(hypermutation)使得免疫组库的编码序列异常丰富,从而形成了人体内复杂的免疫组库系统。研究证明人体内绝大部分疾病均与适应性免疫系统相关,因此通过某种技术手段准确的得到这些BCR和TCR的序列信息将具有非常重要的临床价值。
       高通量测序技术可以实现快速,准确地获得大量DNA或者RNA的序列信息,并且已发展出多种非常成熟的分析技术,保证数据的有效解读。但是免疫组库因为其CDR3区域十分多变,序列长度较短一般只介于15-60nt,导致常规用于转录组及基因组测序的技术并不完全适用。因此产生了这一新的高通量测序领域--免疫组测序(Immunosequencing)。

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发表于 2017-7-1 16:18:28 | 显示全部楼层
CDR3区域为什么是最重要的呢,可以介绍一下吗
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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 楼主| 发表于 2017-7-1 22:05:21 | 显示全部楼层
Jimmy 发表于 2017-7-1 16:18
CDR3区域为什么是最重要的呢,可以介绍一下吗

好问题,请看第二篇 http://www.biotrainee.com/thread-1781-1-1.html
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