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【免疫组测序-2】免疫组测序背景介绍(免疫组库)

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发表于 2017-7-1 22:04:32 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 DarrenLee 于 2017-7-1 22:34 编辑

上文我们提到TCR和BCR的多样性这一最大的特点,所以高通量测序才是解析人类免疫库系统在目前看来最优的方案。那么测整个的TCR和BCR可行吗?答案是:一、理论上不可行;二、实际上更不可行;

我们来看下编码抗原免受体的基因,大部分区段其实是相同的,而只在V-D-J基因的选择及中间的连接部分有各种各样的差异,所以测多了反而无法确认reads到底属于哪一T细胞or B细胞。而测免疫库我们主要是想知道其BCR, TCR的多样性及特定细胞类型的富集性,其中的CDR3区就可以理解为T or B 细胞的身份证,是一个可以代表免疫细胞种类的这么一段序列。
CDR3同时又是决定免疫细胞识别特定抗原的功能区域(看图),所以免疫组库测序其实就是测CDR3,一旦发现某类CDR3序列出现了明显的扩增,说明该类免疫细胞在体内的比例大量上升,假如是以为白血病患者,那很有可能这就是那个病变的细胞类型,治疗后的随访就可以有效监控该类细胞的数量,并以此来判断治疗的有效性,同时还可以借助该技术监控预后及复发情况。并能在极高灵敏度的情况下,提前发现,提早预防。所以免疫库测序在癌症治疗及治疗跟踪领域必将发挥重要的作用!