搜索
查看: 2652|回复: 1

【免疫组测序-2】免疫组测序背景介绍(免疫组库)

[复制链接]

5

主题

9

帖子

57

积分

版主

Rank: 7Rank: 7Rank: 7

积分
57
发表于 2017-7-1 22:04:32 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 DarrenLee 于 2017-7-1 22:34 编辑

上文我们提到TCR和BCR的多样性这一最大的特点,所以高通量测序才是解析人类免疫库系统在目前看来最优的方案。那么测整个的TCR和BCR可行吗?答案是:一、理论上不可行;二、实际上更不可行;

我们来看下编码抗原免受体的基因,大部分区段其实是相同的,而只在V-D-J基因的选择及中间的连接部分有各种各样的差异,所以测多了反而无法确认reads到底属于哪一T细胞or B细胞。而测免疫库我们主要是想知道其BCR, TCR的多样性及特定细胞类型的富集性,其中的CDR3区就可以理解为T or B 细胞的身份证,是一个可以代表免疫细胞种类的这么一段序列。
CDR3同时又是决定免疫细胞识别特定抗原的功能区域(看图),所以免疫组库测序其实就是测CDR3,一旦发现某类CDR3序列出现了明显的扩增,说明该类免疫细胞在体内的比例大量上升,假如是以为白血病患者,那很有可能这就是那个病变的细胞类型,治疗后的随访就可以有效监控该类细胞的数量,并以此来判断治疗的有效性,同时还可以借助该技术监控预后及复发情况。并能在极高灵敏度的情况下,提前发现,提早预防。所以免疫库测序在癌症治疗及治疗跟踪领域必将发挥重要的作用!



前面侃侃而谈,最后再来点干货,推荐大家关注下adaptive biotechnologies官网,免疫组的研究文献,测序技术各方面可以说是行业最顶尖了。

回复

使用道具 举报

0

主题

29

帖子

259

积分

中级会员

Rank: 3Rank: 3

积分
259
发表于 2017-9-7 21:32:25 | 显示全部楼层
治疗跟踪。。。它周期很长的吧
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|手机版|小黑屋|生信技能树 ( 粤ICP备15016384号  

GMT+8, 2019-9-16 09:11 , Processed in 0.077744 second(s), 23 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.