搜索
查看: 3229|回复: 2

[other] Sentieon: GATK的手游加速器

[复制链接]

11

主题

50

帖子

275

积分

版主

Rank: 7Rank: 7Rank: 7

积分
275
发表于 2017-7-21 01:22:10 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 Mint 于 2017-7-21 01:23 编辑

哈喽大家好久不见,薄荷姐闭关修炼七七四十九回归喽。一出关发现大家如火如荼讨论 SNP, 齐心合力怼人家GATK卡。那来来来,姐有GATK手游加速器Sentieon,测评速度是GATK3.3的20~51倍,惊不惊喜?意不意外? 有兴趣咱再接着往下聊。

先聊聊Sentieon 的人设吧,这是一公司产品,我不晓得各位能否用成反正姐用得正嗨。论坛里阿尔的太阳也曾经提到过它,对于性子急天亮前就要结束战斗的人来说,它绝对是速战速决的神兵利器。

究竟有多快 ?

F1

F1
在MacBook 速度 KO GATK3.3在服务器上的速度:

F2

F2
还有大家伙关心的Variant Calling 表现:

T1

T1
反正我看完以后是火速试了一把,速度不能更满意。好奇人肉了一下这家公司,原来是加州硅谷玩算法的特种部队, 才开张3年奖拿了一堆:

P

P

最近在国内的大新闻是和GeneDock合作发布了基于云计算的人全基因组标准化分析服务,大声吆喝“99元/次只要99元”。
Screen Shot 2017-07-20 at 11.42.41 AM.png

辣么问题来了:未来有什么工作绝对不会被人工智能取代?答案:你妈。

1

1

2

2

3

3

4

4

5

5

题末话:大伙试试看, 这个软件能用上的话,再考虑续一篇使用流程。也期待留言体验哦~各位亲有装上GATK 4的也务必留言, 本人太懒正在等你先装~)

PS: 不是软广!!!  Sentieon/GeneDock公关看见此文,请速与生信技能树吉米联系,斑竹们一起大盘鸡的愿望还未实现,谢谢。)
Reference:
https://www.sentieon.com/wp-content/uploads/2017/04/Sentieon_DNA_white_paper_Aug_2015-.pdf




上一篇:从NR库提取特定物种分类的序列
下一篇:gnomAD——Broad Institute的变异数据库又一力作
回复

使用道具 举报

5

主题

37

帖子

485

积分

中级会员

Rank: 3Rank: 3

积分
485
发表于 2017-7-21 09:52:46 | 显示全部楼层
Sentieon 是收费的,就是商业版的 GATK。开源的 GATK4 的速度也提升了不少,坐等有人发测评
回复 支持 反对

使用道具 举报

11

主题

50

帖子

275

积分

版主

Rank: 7Rank: 7Rank: 7

积分
275
 楼主| 发表于 2017-7-21 21:18:20 | 显示全部楼层
W.Peng 发表于 2017-7-21 09:52
Sentieon 是收费的,就是商业版的 GATK。开源的 GATK4 的速度也提升了不少,坐等有人发测评 ...

噢那真可惜了。多谢反馈
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|手机版|小黑屋|生信技能树 ( 粤ICP备15016384号  

GMT+8, 2019-11-15 16:55 , Processed in 0.040817 second(s), 29 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.