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gnomAD——Broad Institute的变异数据库又一力作

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发表于 2017-7-21 11:46:04 | 显示全部楼层 |阅读模式
网址: http://gnomad.broadinstitute.org/
简介(20170721):The Genome Aggregation Database (gnomAD) is a resource developed by an international coalition of investigators, with the goal of aggregating and harmonizing both exome and genome sequencing data from a wide variety of large-scale sequencing projects, and making summary data available for the wider scientific community. The data set provided on this website spans 123,136 exome sequences and 15,496 whole-genome sequences from unrelated individuals sequenced as part of various disease-specific and population genetic studies.
使用:首页提供检索口,可以直接检索基因、variant或者region,结果会提供基本信息、coverage信息及variant的具体信息等。另外提供下载vcf文件。数据量大,数据使用上也没有太多限制。
缺陷:没有提供原始数据下载,没有phenotype的数据提供,不能保证所有个体都没有你关心的疾病。





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