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[linux] 中国科大开源镜像站的bioconda新镜像申请

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发表于 2017-8-2 08:50:22 | 显示全部楼层 |阅读模式
我在中国科大开源镜像站的github上提交了bioconda新镜像申请,现在处于投票阶段,大家快去投票。地址在这:https://github.com/ustclug/mirrorrequest/issues/125
请在 Github Issue 页面使用 Emoji 表情来投票。 请参考这里的使用说明。

还有管理员说没有找到可靠的同步方法。希望能由bioconda用户想办法找寻一个同步方案。已经将其标记为hard to sync
大神们赶紧去献策啊!




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https://github.com/zd200572/
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 楼主| 发表于 2017-8-28 16:24:08 | 显示全部楼层
本帖最后由 zd200572 于 2017-10-29 08:57 编辑

2017.10.28更新中科大源地址
发现中科大源也有了bioconda镜像,但是只有linux版本的,地址如下:
清华源
[AppleScript] 纯文本查看 复制代码
conda config --add channels [url]https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/[/url] 
conda config --set show_channel_urls yes

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发表于 2017-8-2 08:55:23 | 显示全部楼层
可以先把 TUNA 的源先用着嘛,挺快的
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 楼主| 发表于 2017-8-2 08:57:31 | 显示全部楼层
尚目目 发表于 2017-8-2 08:55
可以先把 TUNA 的源先用着嘛,挺快的

不是只有conda?
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 楼主| 发表于 2017-8-2 08:57:42 | 显示全部楼层
尚目目 发表于 2017-8-2 08:55
可以先把 TUNA 的源先用着嘛,挺快的

不是只有conda?
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发表于 2017-8-2 13:55:19 | 显示全部楼层

这个好像是无所谓的,其实Miniconda\Bioconda\Anaconda区别应该是在于本身默认安装了哪些包,本质上应该是一样的,就是提供一个conda环境而已。不知道我的理解对不对,反正我装的Miniconda直接这样用是没什么问题的。
我的~/.condarc:
[Bash shell] 纯文本查看 复制代码
channels:
  - bioconda
  - r
  - defaults
  - conda-forge
  - [url]https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/[/url]
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