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R包搬运之ggcyto: Visualize Cytometry data with ggCyto

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发表于 2017-8-17 15:30:26 | 显示全部楼层 |阅读模式
今天想画散点图,觉得密度甚大,于是google “scattergram alternative”, 第一个跳出了这个包,使用了觉得还不错,总之就是套用了ggplot里的geom_hex, 即一定区域内的数目,用颜色表示密度,可以减少可视化数据的复杂度,具体参考https://www.chrisstucchio.com/bl ... e_scatterplots.html
当然除了我需要的简单方法外,还可以做类似流式细胞的图,毕竟包名叫做“ggCyto”。

R包教程地址:http://master.bioconductor.org/h ... ioC2015/ggcyto.html




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 楼主| 发表于 2017-8-17 15:33:24 | 显示全部楼层
有用的句子~最喜欢变色了~~
scale_fill_gradient(trans = "sqrt", low = "gray", high = "black")
scale_fill_gradientn(colours = brewer.pal(n=4,name="OrRd"),trans="sqrt")
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