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宏基因组分析教程-Analysis of Metagenomic Data

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发表于 2017-10-12 08:56:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
加拿大生信网
加拿大安大略研究所建立的生物信息网(https://bioinformatics.ca/),每年组织多场生物信息学线下培训,并线上共享培训资料。有超多生信学习PPT和视频,每一份都价值不菲。
宏基因组数据分析培训
2016年6月22-24日,在温哥华举办了宏基因组数据分析专题培训,我们可以点击主页中宏基因组专题栏目的 "Access Content" 访问这次培训的材料。
课题内容简介
本次课题一共分为7节,简要介绍了背景、扩增子、宏基因组、宏转录组的分析思路和基本原理。同时提供全套的课件(PDF+PPT)和讲解视频(Youbute)在线。
注:本次课程以基础知识、原理讲解为主,非常适合刚入行的小伙伴认真学习。
更高级的数据分析实战课程,过几天就陆续分享给大家。
课程目录:
  • 宏基因组学简介
  • 扩增子分析物种组成
  • 基于16S预测宏基因组
  • 宏基因组物种组成
    • 比较16S与宏基因测序
    • 各种分析宏基因组物种组成方法
    • Metaphlan2分析宏基因组样品
    • STAMP统计组间物种差异
  • 宏基因组功能组成
    • 功能与物种组成区别
    • 了解功能相关数据库
    • 理解宏基因组基因拼接的优缺点
    • HUMANN注释功能基因
    • STAMP统计组间功能差异
  • 宏转录组
    • 理解宏转录组的机遇和挑战
    • 宏转录组的适用范围
    • 样品准备与实验设计
    • 数据处理的关键步骤
    • 处理简单的宏转录组示例
  • 微生物组生物标记物挖掘
    • 生物标记物的定义和应用
    • 如何从微生物组数据中鉴定生物标记物
    • 分析实战
    • 理解分析的原理

资料下载
这是网站的速度特别慢,打开个PDF都要等好久,视频在Youtube上需要翻墙才能观看,这两天要开十八大,各种翻墙工具基本都难用,小编花了大约一天的时间,将课题全套的课件PPT、PDF,以及高清版视频 720p mkv进行下载、重命名整理,并保存至百度云。
不想自己下载和整理的朋友,请分享此文至朋友圈,让更多需要的人看到,并截图发送至后台,24小时内会有小编回复您下载链接。
Youbute视频链接Reference猜你喜欢写在后面
为鼓励读者交流、快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”专业讨论群,目前己有国内外三十多位PI,三百多名一线科研人员加入。参与讨论,获得专业指导、问题解答,欢迎分享此文至朋友圈,并扫码加创始人好友带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-年级/职务”,备注不完整可能就不能做朋友了。技术问题寻求帮助,首先阅读如何优雅的提问学习解决问题思路,仍末解决推荐生信技能树-微生物组版块(http://www.biotrainee.com/forum-88-1.html) 发贴,并转发链接入群,问题及解答方便检索,造福后人。
学习16S扩增子、宏基因组思路和分析实战,快关注“宏基因组”,干货每日推送
点击阅读原文,跳转最新文章目录阅读https://mp.weixin.qq.com/s/5jQspEvH5_4Xmart22gjMA




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发表于 7 天前 | 显示全部楼层
这个排版稍微可以看看了,继续加油哈
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发表于 7 天前 | 显示全部楼层
你们课题组很不错,http://bailab.genetics.ac.cn/
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