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OncoArray基因分型平台-最大规模的全基因组肺癌易感性研究

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发表于 2017-10-24 09:29:21 | 显示全部楼层 |阅读模式

在一项由多国研究人员组成的国际研究组项目中,研究人员利用OncoArray基因分型平台,完成了最大规模的全基因组肺癌易感性研究,从中发现了一些新的癌症易感位点。这一研究成果公布在6月12日的Nature Genetics杂志上。

肺癌是全世界发病率和死亡率最高的癌症之一。每年有超过500万例新发肺癌病例,其中85%属于非小细胞肺癌。这种类型的肺癌主要是由两个亚型代表:肺腺癌和肺鳞状细胞癌。它们可能起源于不同的环境因素或生物过程,但吸烟并不总是主要原因,研究证明肺癌的遗传率约为18%。之前的全基因组关联研究发现了几种肺癌易感基因座,但其中大部分的遗传性仍然无法解释。这项最新研究重新分析了肺癌病例和对照组的基因分型。

这项研究由Norris Cotton癌症中心的Christopher Amos博士,国际癌症研究机构的James McKay博士,以及多伦多大学的Rayjean Hung博士领导完成。涉及样品包括14,803个肺癌样品和12262个已有数据的欧洲人对照样品,总共有29266个样品和56,450个对照。

从中研究人员确定了18个具有全基因组意义的易感基因位点,其中有10个是之前从未发现过的。这些新的基因位点凸显了肺癌亚型:肺腺癌和肺鳞状细胞癌易感模式的显著变化——4个与整体肺癌相关,6个位点与肺腺癌相关。研究人员也发现了与端粒功能相关的几个基因,它们在肺腺癌易感风险中扮演了重要的角色,但是对肺鳞状细胞癌易感风险并无显著影响。

Amos表示:“这项研究中最令人兴奋的是影响肺癌的新基因发现。研究为分析肺癌患病风险提供了新的见解,而且特别重要的是我们发现了几个影响端粒功能的新突变,也会影响肺腺癌易感风险。同时我们也发现了烟碱受基的一种亚基周围出现了突变,这种亚基能影响肺癌患病风险,吸烟习惯,而且似乎在小脑中起重要作用,后者很少涉及成瘾行为的影响。”

未来通过进一步的研究将更好地了解靶基因在影响肺癌风险,吸烟行为和吸烟对脑生物学影响方面的作用。

除此之外,近期Nature Genetics杂志也在肺癌细胞中发现了一些新的驱动突变(driver mutations),可能用于基因靶向治疗和免疫治疗。

研究人员检查了来自于两种最常见肺癌类型的1144个基因组分析谱:肺腺癌和肺鳞状细胞癌。这项研究的高度统计显著性,可让研究人员能够识别影响几个蛋白质(负责细胞中的信号)的新型驱动突变。在这项研究中,科学家使用统计方法,来区分驱动突变和所谓的过客突变(passenger mutations),这些突变发生在癌症的发展过程中,但不会引发肿瘤生长。



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 楼主| 发表于 2017-10-24 09:30:16 | 显示全部楼层
使用由多个癌症联盟开发的OncoArray基因分型平台,最近大量的聚合基因组关联研究确定了肺癌的新易感基因座,这是全世界癌症死亡率的主要原因。虽然吸烟是主要的危险因素,但过去的研究表明,肺癌的遗传率估计为18%。以前的基因组关联研究已经确定了几种肺癌易感基因座,但其大部分遗传性仍然无法解释。本研究对肺癌病例和对照进行了额外的基因分型。

该研究由克里斯托弗·阿莫斯博士,诺里斯棉花癌症中心人口科学临时总监兼副主任,国际癌症研究机构James McKay博士;和Rayjean Hung博士,Lenenfeld-Tanenbaum研究所和多伦多大学,以及全球许多肺癌调查员共同参与研究。共有14,803起案件和12262次欧洲血统控制与现有数据,共29266例和56,450次对照。研究人员确定了18个易感基因座,实现全基因组学意义,包括10个新的基因座。新的基因座突出了肺癌亚型腺癌和鳞状细胞肺癌之间的风险模式的显著变化,四个与肺癌相关的基因座和与肺腺癌相关的六个基因座。发现与端粒功能相关的几个基因的变体在对腺癌风险的贡献中起重要作用,但对鳞状细胞癌的风险无显著影响。

他们的发现,“大规模关联分析确定新的肺癌易感基因座和组织学亚型遗传易感性的异质性”将在即将出版的“自然遗传学”杂志上发表。

Amos表示:“特别令人兴奋的是研究的重要性以及以前没有报道的影响肺癌的基因的新发现。” “这项研究肯定会导致关于影响肺癌风险的机制的新思路,特别是我们确定了影响端粒功能的几种新型变体,影响肺腺癌的风险,此外,我们发现影响肺癌风险的烟碱受体亚基的变异和吸烟行为,似乎在小脑中起主要作用,这很少涉及影响成瘾行为。”进一步的研究将更好地了解靶基因在影响肺癌风险,吸烟行为和吸烟对脑生物学影响方面的作用。

https://medicalxpress.com/news/2 ... susceptibility.html
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