Python小测006

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真核生物中成熟RNA是DNA通过剪切掉内含子，剩余外显子连接后，再进行翻译一段DNA序列：ATGGTCTACATAGCTGACAAACAGCACGTAGCAATCGGTCGAATCTCGAGAGGCATATGGTCACATGATCGGTCGAGCGTGTTTCAAAGTTTGCGCCTAG
内含子1：ATCGGTCGAA
内含子2：ATCGGTCGAGCGTGT
剪切后拼接结果：ATGGTCTACATAGCTGACAAACAGCACGTAGCATCTCGAGAGGCATATGGTCACATGTTCAAAGTTTGCGCCTAG

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dna1 = "ATGGTCTACATAGCTGACAAACAGCACGTAGCAATCGGTCGAATCTCGAGAGGCATATGGTCACATGATCGGTCGAGCGTGTTTCAAAGTTTGCGCCTAG"
dna2 = "ATCGGTCGAA"
dna3= "ATCGGTCGAGCGTGT"
a = dna1.index(dna2)
b = dna1[:a]+dna1[a+len(dna2):]
c = b.index(dna3)
d = b[:c]+b[c+len(dna3):]
print(d)

lin_

dna = 'ATGGTCTACATAGCTGACAAACAGCACGTAGCAATCGGTCGAATCTCGAGAGGCATATGGTCACATGATCGGTCGAGCGTGTTTCAAAGTTTGCGCCTAG'
intron_1 = 'ATCGGTCGAA'
intron_2 = 'ATCGGTCGAGCGTGT'
intron_1_start_pos = dna.find(intron_1)
intron_1_end_pos = intron_1_start_pos + len(intron_1)
intron_2_start_pos = dna.find(intron_2)
intron_2_end_pos = intron_2_start_pos + len(intron_2)
print(intron_1_start_pos, intron_1_end_pos)
print(intron_2_start_pos, intron_2_end_pos)
coding_dna = dna[:intron_1_start_pos] + dna[intron_1_end_pos:intron_2_start_pos] + dna[intron_2_end_pos:]
coding_dna

lin_

python测试7
我们知道用add方法可以给集合增加元素，如：
>>> set1 = {'qwe', 'asd', 'z'}
>>> set1.add('123')
>>> set1
{'123', 'qwe', 'asd', 'z'}


当add已有元素时，则不会有任何变化，这也是集合唯一性的表现，现在有一个全是字符串的集合，你设计程序，当加入一个字符串是集合中已有元素时，会自动在字符串后面加上“_1”再加入元素中，如
set1 = {'qwe', 'asd', 'z'}
#加入'qwe',实际加入qwe_1，集合变成
{'qwe_1', 'qwe', 'asd', 'z'}


进一步，如果已有'qwe'和'qwe_1'，再加入'qwe'时，实际加入'qwe_2'，以此类推。
'''添加的元素末尾第二位不能带有'_' ，比如'abc_d'。 '''


set1 = {'qwe', 'asd', 'z', 'qwe_1', 'qwe_7','qwe_3'}
a = 'qwe'

if a not in set1:
    set1.add(a)   #不在集合，直接加入
else: #集合中已有该元素
    if a[-2] != '_':#末尾第二个检查是不是'_'
        a = a + '_1'    #末尾添加_1
        if a not in set1:
                set1.add(a)   #检查集合是不是有了，没有加入集合
        else:        #集合有了
            b =1
            while True:
                a = a[:-1] + str(int(a[-1])+b)
                if a not in set1:
                    set1.add(a)
                    break      #容易写死循环
                else:
                    b+= 1
        
print(set1)

lin_

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骑着乌龟胖大海

seq='ATGGTCTACATAGCTGACAAACAGCACGTAGCAATCGGTCGAATCTCGAGAGGCATATGGTCACATGATCGGTCGAGCGTGTTTCAAAGTTTGCGCCTAG'
pattern='ATCGGTCGAA'
pattern2='ATCGGTCGAGCGTGT'
def cut(pattern,pattern2):
    print(seq.replace(pattern,'').replace(pattern2,''))
cut(pattern,pattern2)