大部分protein-protein interactions是通过实验技术和计算机预测方法,PPIs主要一些用于解释全基因组遗传筛选、功能基因数据和阐明疾病功能。 GeneSense互作PPI,访问网络:www.biomedsense.org/genesense.php 浏览器支持:GeneSense 要求 a JavaScript-enabled browser如:Google Chrome andInternet Explorer GeneSense主要文献数据库有:IntAct,HPRD,MINT,BioGRID,PPIs整合数据库有PINA,APID,STRING,MiMI和UniHI PINA数据库整合六个包括:IntAct,MINT,BioGRID,DIP,HPRD和MIPS Mpact GeneSense: 1.提供基因注释和整合不同数据来源基于HGNC。 2.PPI网络基于文献和实验数据无假阳性 3.建立友好工具包括:nodenet(note network)、leafnet(leaf network),loopnet(loop network) 主界面: 基因注释信息有:同源信息、临床信息、基因信息、参考信息、通路信息和PPI信息,名称基于HGNC和uniprot提供准确注释蛋白序列。
如搜索”TP53” 点击tp53 Molecular information中包含Homologs information,clinical information, gene information, reference information, Some otherinformation, pathway information. 点击:protein-protein interaction 中的NodeNet 上游蛋白:
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