搜索
查看: 3071|回复: 0

GeneSense一个PPI在线互作网络

[复制链接]

12

主题

26

帖子

592

积分

版主

Rank: 7Rank: 7Rank: 7

积分
592
发表于 2017-11-17 12:01:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
大部分protein-protein interactions是通过实验技术和计算机预测方法,PPIs主要一些用于解释全基因组遗传筛选、功能基因数据和阐明疾病功能。
GeneSense互作PPI,访问网络:www.biomedsense.org/genesense.php
浏览器支持:GeneSense 要求 a JavaScript-enabled browser如:Google Chrome andInternet Explorer
GeneSense主要文献数据库有:IntActHPRD,MINT,BioGRIDPPIs整合数据库有PINA,APID,STRING,MiMIUniHI
PINA数据库整合六个包括:IntAct,MINT,BioGRID,DIP,HPRDMIPS Mpact
GeneSense
            1.提供基因注释和整合不同数据来源基于HGNC
           2.PPI网络基于文献和实验数据无假阳性
           3.建立友好工具包括:nodenet(note network)leafnet(leaf network),loopnet(loop network)
主界面:
1.png
基因注释信息有:同源信息、临床信息、基因信息、参考信息、通路信息和PPI信息,名称基于HGNCuniprot提供准确注释蛋白序列。

如搜索”TP53”
2.png
点击tp53
3.png
Molecular information中包含Homologs information,clinical information, gene information, reference information, Some otherinformation, pathway information.
点击:protein-protein interaction 中的NodeNet
4.png
上游蛋白:
5.png

回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|手机版|小黑屋|生信技能树 ( 粤ICP备15016384号  

GMT+8, 2020-3-31 06:56 , Processed in 0.023865 second(s), 28 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.