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新的GO/KEGG注释网页工具-Metascape

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发表于 2017-11-25 18:22:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
基因富集大家最常用的软件是David,那么有没有其他更好用更直观的工具呢?答案是Yes!其实David的数据更新一直比较慢,2016年前大家用的David 6.7版本是数年前发布的,而David 6.8一直到去年的10月才发布。

我们给大家介绍一个新工具,叫做Metascape,使用更简单,结果更酷炫!

这 个工具的最新数据库更新是在2017年的3月,如果你担心这个工具的权威性,查一下2017年发表在Nature Microbiology上的 Systems-based analysis of RIG-I-dependent signalling identifies KHSRP as an inhibitor of RIG-I receptor activation. 这篇文章的基因富集就是使用了Metascape这个工具!

那么还有什么好处呢?那就是图啦!这个工具甚至可以帮你生成一份PPT,里面是全部的分析结果包括图表!

下面来看看怎么使用吧!
(1)访问 http://metascape.org
(2)把标准的基因名的列表贴到页面上的窗口里
(3)Submit后,需要选择这些基因所属的物种,如果我们研究的是人类的物种,那就选择H.sapiens即可。
(4)选择进行富集分析,即点击“Express Analysis”按钮,页面会显示分析的进度条
(5)静静等待分析结束,然后点击下图中的Analysis Report Page的按钮。
基本上看他网站上面的介绍短片即可: http://metascape.org/video/intro/



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你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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