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TCGA大作战——初步分析RNA-seq数据02

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发表于 2017-12-9 02:40:49 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 mckf111 于 2017-12-16 18:35 编辑

本篇为第二部分,主要记录数据下载和整理过程。

数据选择
一开始,本来是想探索一下癌组织和正常组织(tumor_matched_normal,简称TN)的基因差异化表达情况(differential expression,简称DE)为了加快分析速度,所以选了在Firehose上排在第一位的ACC (Adrenocortical carcinoma,肾上腺皮质癌),因为只有区区92个样本,可下载完竟发现,其中并没有TN数据
。。。

代码亲测可以运行,欢迎指正。

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