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如何参与生信技能树论坛建设

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发表于 2016-9-22 21:14:19 | 显示全部楼层 |阅读模式
超长文—》如何参与生信技能树论坛建设

前言
论坛建设的初衷相比大家都有所了解,如果有人还有疑问,可以去读读我博客http://www.bio-info-trainee.com/1883.html关于论坛成立的博文。参与到论坛建设的都是一群热爱学习,也乐于整理和分享学习笔记,扩大交流圈子的小伙伴。这里我做一个详细的入门指引,关于大家如何更方便的参与建设生信技能树论坛建设。
论坛架构
现在论坛的板块架构已经初步成型,暂时不会有太大的变动,包括生信基础,在线应用,组学大全,研究热点这4个需要大家积极参与的板块,以及学习资源,互动作业,有偿专区这3个需要培训后才能发帖的板块,还有问答板块和生老病死板块暂时被隐藏了,大家暂时不需要考虑到,板块本身会持续进化,如果大家有更好的建议欢迎随时找我聊。
生信基础板块
那我们先看看需要大家积极参与的生信基础,这个大板块可以细分成计算机+统计学+生物学+可视化+医学+测序基础,参与进来并不需要多么高深的知识水平,无论处于哪个学习阶段的小伙伴都可以积极参与。

现在这个板块有版主两名,大家可以直接站内联系他们跟他们一起探索板块建设方案,在大方向不变的前提下,可以自由发挥。保证每一个基础知识都有一个长期更新的目录,根据现在的参与人手情况来合理安排这个基础知识学习计划,现在做得比较好的是统计学基础这个板块,如下:

其它板块努力向这个板块靠齐,即使有些基础知识点还没有整理好,也可以先列到目录里面,还可以给一些基础知识学习的视频,书籍,等等学习资源的推荐,但不要硬生生的给一个链接,要给出一些理由及大致的介绍。理想的目标是至少有一百名积极参与的初学者,在我们的影响下都打下了扎实的基础,而且顺便做好了整理及分享的工作,造福后人。
在线应用
这个板块之所以独立成一个一级板块,就是因为生物信息学数据处理业界有一个始终未能完美解决的争论à生信从业者是否需要学习编程的问题。本论坛不愿意陷入类似的口水战之中,但不可忽略的是大批量医学工作者从事科研研究时的确很难主动花费大量时间来正规入门生物信息学,这个板块就是为他们准备的,里面会列出大量常用的临床医学科研相关的数据库,以及知名度非常高的在线工具,包括DAVIDTCGAENCODECOSMIC等等。理论上完全掌握这些在线工具,就可以独立的做好数据分析了。本板块暂时有2位版主,大家可以直接站内联系他们,他们也公布了自己的微信号,大家可以直接交流。

这个板块真心是不想学编程的小伙伴的福音,不过还是得去学习一个在线工具或者数据库的用法。对我们掌握了linux系统以及编程语言的小伙伴们来说,与其去学别人开发的在线工具如何使用,还不如自己写程序解决。
组学大全
对生物信息学这样的交叉学科的总结想做到面面俱到又分类清晰似乎是不大可能,我们论坛成立初期,就陷入了板块杂乱无章的泥沼。好在现在勉强清晰的得到了组学大全这样一个稍微完整和清晰的大板块,目前有基因组,转录组,蛋白质组,代谢组,表观组和微生物组6个子板块,如下:

想彻底搞清楚一个组学,并不是简单,所以本板块不建议初学者在这里发帖,目前论坛管理员团队正在积极寻找有一定项目经验的朋友来参与整理及分享。鉴于他们可能是纯粹的奉献,而不是像其他初学者一样是伴随着论坛成长,他们的付出并不是无偿的。首先他们的个人品牌可以在这里得到推广,包括个人博客,公众号,实验室招聘信息等,其次在论坛产出的版权均为个人所有,最后万一论坛有幸盈利,比如我们的组学最佳实践指导的学习小册子出版啦,或者有兴趣的朋友可以开培训班什么的,盈利会根据贡献度分成。
研究热点
定下这个板块的名字并不是一件易事,为此我咨询了不少业界精英,也只能说是暂时给定了一个临时名。

机器学习、单细胞测序、三代测序、芯片数据处理等等,都是属于不同技术大类在上述各种组学中均有应用。比如三代测序,目前的pacbio即可以用于基因组拼装,又可以做转录组。单细胞测序也是,即可以解释不同细胞基因组差异,也可以做转录组和表观。芯片数据处理更是几乎渗透到了所有组学研究之中。至于其它的GWASmeta分析或者很多其它我们还不了解的研究方向,我们这里只能取他们的唯一共性来命名,就是研究热点。这个板块是不确定性最强的,可能会持续不断的添加新的小板块,或者干脆删除合并某些板块。目前这个板块的管理情况跟组学大全板块类似,也是由管理团队邀请特定的负责人和积极学习者一起负责起板块建设事宜。
学习资源
此板块大部分内容就是从我的生信菜鸟团(群号201161227)建设的两年间的群公告,都是本人作为一个初学者入门过程搜集的各种学习资料。

在论坛建设的早起,已经有热心的小伙伴帮忙把大部分资料整理转发到了我们相应的板块,老实说,这些资料足够大部分初学者入门了,尤其是那些生信课程,国内外的课程ppt及视频均有,都是我们论坛管理员团队精挑细选的,大家有非常想推荐的资料也可以发在这里,管理团队会定期整理和评价。生信自媒体专辑是我们的友情链接,国内生物信息学早起发展阶段涌现了一系列的个人博主和公司团体,他们或多或少的为生物信息学在中国的推进做了些许贡献,如果大家有其它可以推荐的也可以继续开新帖。公司宣传资源专区是我一直比较推崇的另外一种学习方式,了解公司的科研项目做什么,他们是如何宣传的,初学者就应该知道自己该学什么了。
互动作业
互动作业板块在我们论坛主页的排名非常靠前,仅次于生物信息学基础板块了。足以说明我们对它的重视,在如今这样的一个互联网时代来经营论坛这样过气的产品实属不易,其余的板块建设其实都类似于博客合集,需要不少的小伙伴保持热情的持续不断的产出高质量内容。互动作业板块不一样,任何人都可以进来浏览一些题目和解答,每解决一个问题,你的能力就得到一个明显的提升。

跟着帖子学习的人可以直接得到发帖人的指导,不管是互动的脚本作业,还是告诉你们如何下载常见的生物信息学数据资源,或者是直接的一个项目实践,这些都是需要花费不少时间和精力的,同时也欢迎大家在这几个版块发一下比较简单的任务,这样或许会对初学者更有益。
有偿专区
这是我对我们论坛的一个盈利点的探索,毕竟论坛前期我们管理员团队还是无私奉献了不少,可以适当获取一下物质上的回报。

大家可以把自己拿手的图片放在里面展示,如果有需要的人会联系你们付费帮忙制作可视化科研文章用图。或者是付费帮忙下载某些资源,或者直接在线指导一些生物信息学软件的使用。但我本人商业头脑很薄弱,不是很擅长这一块,大家有什么更好的建议可以直接联系我哈。
问答专区
这个板块暂时是隐藏的,论坛早期流量有限,就算有人来发帖求助,也没有什么人会及时解答,就先不放在论坛主页,免得分散大伙的注意力。

但我们生信技能树还是对这个板块充满信心的,这个问答专区会涉及到生物信息学数据处理的方方面面,可以设置为收费问答。
生老病死
这个板块同样被隐藏起来了,主要是存放生物信息学在改变人类生活造福人类方面的应用,希望可以偏科普一点的,类似于菠萝因子那个关于癌症公众号,但是我们会涉及到生老病死的各个领域。包括产前检测等优生优育项目,癌症早期筛查等疾病专项,用药指导,减肥,美容,社交等等。如果大家有合适的人,欢迎推荐给我具体聊聊。






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你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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发表于 2016-9-22 22:41:28 | 显示全部楼层
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