搜索
查看: 1398|回复: 4

预测氨基酸替换的致病性及分子机制:MutPred工具的使用

[复制链接]

6

主题

15

帖子

323

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
323
发表于 2017-12-13 22:36:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
MutPred的功能是预测氨基酸替换后的致病性及其分子机制,旧版本见链接:http://mutpred1.mutdb.org/
新版本更新为MutPred2,见网站链接:http://mutpred2.mutdb.org/index.html,如下图所示,点击predict here
操作步骤见下图:

输入邮件地址、输入想要查询的蛋白质序列、最后submit等结果。
重点讲中间输入的蛋白质序列怎么来的:
假定寻找BRCA2 蛋白质氨基酸序列改变的致病性和分子机制,则在网页中输入BRCA2 ,点击搜索,在结果展示页点击第一个,如下图所示:

进入后,找到CDS,查看translation,即该蛋白质对应的野生型氨基酸,见下图:

回到MutPred2的页面,箭头修改为:
>BRCA2_HUMAN 替换氨基酸及位置
框框里为野生型的氨基酸序列,即上个步骤找到的translation。见下图:
提交后,邮箱会收到工作确认邮件,大约几分钟后就会收到结果,示例结果如下:




上一篇:蛋白质结构模型和功能预测:I-TASSER工具的使用
下一篇:【py】rosalind1_Counting DNA Nucleotides
回复

使用道具 举报

4

主题

51

帖子

480

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
480
发表于 2017-12-13 23:40:59 | 显示全部楼层
不错,美女一出手,论坛抖三抖
回复 支持 反对

使用道具 举报

6

主题

15

帖子

323

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
323
 楼主| 发表于 2017-12-14 13:35:22 | 显示全部楼层
bioinfotrainee 发表于 2017-12-13 23:40
不错,美女一出手,论坛抖三抖

ahhh,你这词对的真好٩(๑❛ᴗ❛๑)۶
回复 支持 反对

使用道具 举报

4

主题

51

帖子

480

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
480
发表于 2017-12-14 21:17:38 | 显示全部楼层
昨天论坛恰好在你发帖的时候我们论坛在更新
回复 支持 反对

使用道具 举报

6

主题

15

帖子

323

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
323
 楼主| 发表于 2017-12-15 10:38:21 | 显示全部楼层
bioinfotrainee 发表于 2017-12-14 21:17
昨天论坛恰好在你发帖的时候我们论坛在更新

可能论坛知道我即将要发帖了(*/ω\*)
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|手机版|小黑屋|生信技能树    

GMT+8, 2019-5-27 12:21 , Processed in 0.031590 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.