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植物中GO注释

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发表于 2017-12-17 17:28:01 | 显示全部楼层 |阅读模式
    GO注释有很多种方法,blast2go现是主流的注释,数据库定时更新。也有用R包的注释,GSEA等GO注释。今天天介绍的GO注释很简单,只要ID号就可以。不过可能对于相应的物种之前ID号会点差异,可能要对ID号进行ID转换。
介绍这个简称是agriGO(全称为GO Analysis Toolkit and Database for Agricultural Community)
这是一个在线的工具,对应网站为:(http://bioinfo.cau.edu.cn/agriGO/
网站主页为:

分析界面为:

各ID之前对应在分析界面上有注明:

数据选好后是可以直接提交,下面是分析后的界面:

最下面有一个:Detail information 中download下载对应的GO信息。

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