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SRA、SAM以及Fastq文件高速下载方法

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发表于 2017-12-23 16:13:08 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 mckf111 于 2017-12-23 16:14 编辑

这是个简短的教程,目的是介绍几种比较方便快捷的下载SRA文件的方法,主要是如何通过Aspera Connect高速下载,几十至几百M/s的速度。

NCBI-SRA和EBI-ENA数据库SRA数据库: Sequence Read Archive:隶属NCBI (National Center for Biotechnology Information),它是一个保存高通量测序原始数据以及比对信息和元数据 (metadata) 的数据库,所有已发表的文献中高通量测序数据基本都上传至此,方便其他研究者下载及再研究。其中的数据则是通过压缩后以.sra文件格式来保存的。

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发表于 2017-12-23 17:50:01 | 显示全部楼层
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发表于 2017-12-30 15:11:11 | 显示全部楼层
非常感谢,之前下载了aspera一直安装不成功。
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 楼主| 发表于 2017-12-30 17:04:19 | 显示全部楼层
生信小小菜鸟 发表于 2017-12-30 15:11
非常感谢,之前下载了aspera一直安装不成功。

不客气 有问题请及时反映
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