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细菌基因组比对分析

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发表于 2018-1-19 09:52:55 | 显示全部楼层 |阅读模式
最近在做细菌基因组比对,使用BRIG(0.95版本)软件画多基因组比对图,只能得到右边的图,得不到
左边的。当时怀疑软件有问题,就下载了软件的测试数据做了一遍,能正常出图,但是换了自己的数据就不能。
不知各位道友之前有没有遇到过类似的问题呢?也看到小木虫上有人提问过,但没人回复他~~
好纠结~Google也找不到



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 楼主| 发表于 2018-1-30 12:57:33 | 显示全部楼层
折腾了许久,也找到问题所在了。
该软件基于java1.6版本编写,教程上说大于1.6版本都可以。但是该软件一直没更新,这就导致了更高的Java版本并不能完全兼容,因此有些基因组的比对图能做出来,有些基因组的就不能。
所以,只能使用Java1.6。
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