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R新手求助,相邻两个位置的行进行合并?

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发表于 2018-1-23 16:00:16 | 显示全部楼层 |阅读模式
将相邻两个位置的行进行合并。如何进行实现?
1       789501  789600  *       5.29096242272745e-08    1.22006133088957e-05    18.752688172043 225     32      193     558   
1       789601  789700  *       2.52256726059658e-19    6.5140678030651e-16     19.8031742250543        284     2       282     473   
比如上面这两行是这样的,我计划将这种类型的两行合并成一行。筛选条件是第一行的第三列和第二行的第二列之间的差值是1.
其他的列累加。




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发表于 2018-2-6 15:33:44 | 显示全部楼层
bedtools 有cluster和 mergebed, 能实现你的需求。
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 楼主| 发表于 2018-10-16 21:00:04 | 显示全部楼层
zt1989 发表于 2018-2-6 15:33
bedtools 有cluster和 mergebed, 能实现你的需求。

嗯,不过bedtools对输入文件的要求比较高
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