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[variation-calling] 如何得到fusion gene?

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发表于 2018-4-11 17:45:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
我用call gene fusion的软件比如INTEGRATE、PRADA之类的找到了出来了gene fusion。之后进一步,我想基于这些软件的output,做出fasta格式的融合基因,请问大神们知道么?
比如我采用INTEGRATE软件得到了输出文件,输出是bedpe格式的。
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发表于 2018-4-11 20:19:55 | 显示全部楼层
我最近也在捣鼓这个东西,有兴趣的话留个方式交流一下
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发表于 2018-4-20 16:06:09 | 显示全部楼层
你的软件是GitHub上面的吗?是用什么数据call的,bam还是fq?
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