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[其他] stringtie软件生成的gene_abund.tab文件

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发表于 2018-4-23 20:05:40 | 显示全部楼层 |阅读模式
请问大家有没有人用过StringTie计算FPKM,为什么我得到的gene_abund.tab文件里面有6万行,gene——id也不相同,难道是6万个基因吗?可是人类基因组基因只有两万多个呀




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 楼主| 发表于 2018-4-24 12:03:34 | 显示全部楼层
已解决,因为基因组注释文件里面不光含有表达蛋白质的基因,还包括lncRNA、假基因等,所以数目远大于2万
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