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[其他] 求统计作图软件~~~~~~

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发表于 2018-4-25 09:13:10 | 显示全部楼层 |阅读模式
利用StringTie计算出了mRNA-seq数据的基因丰度,也就是gene_abund.tab文件,里面有两万多个基因的FPKM和TPM值。请问有什么软件可以统计出这些数值在各个范围的分布情况,从而确定哪个范围的值是高表达,哪些是低表达呢
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发表于 2018-4-25 15:26:59 | 显示全部楼层
用R吧                                                                           
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 楼主| 发表于 2018-4-27 15:58:31 | 显示全部楼层

用哪个包呢
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发表于 2018-4-28 09:30:30 | 显示全部楼层

看哪个是高表哪个是低表,画热图应该就可以了吧,heatmap
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 楼主| 发表于 2018-10-12 10:12:27 | 显示全部楼层
elaine2017 发表于 2018-4-28 09:30
看哪个是高表哪个是低表,画热图应该就可以了吧,heatmap

好的,谢谢
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