bowtie算法原理探究

Jimmy · 发表于 2016-9-1 10:45:48

这是我很久以前跟学生们一起仿写bowtie这个比对工具的部分功能的时候的记录，仿写经典工具能加深对数据处理本质的理解，也能促进生信菜鸟的入门过程，在这里大力推荐一下，当然，我的帖子你到不用细看，关键是要自己找的感兴趣而且也时候练手的项目，然后花点时间做下去。
http://www.bio-info-trainee.com/?s=bowtie

自己动手写bowtie第一讲：BWT算法详解并建立索引
自己动手写bowtie第二讲：优化索引
自己动手写bowtie第三讲：序列查询。
Bowtie 算法第四讲
Bowtie算法第五讲-index2tally
Bowtie算法第六讲-tally法对bwt索引进行搜索

当然，我的学习方法，并非就是最好的，我只是分享一下，大家有什么想法的，可以在下面跟帖讨论

dulunar · 发表于 2016-9-4 14:58:56

这个我师弟以前也搞过一段时间，他还自己写过一个比对的，我找个时间让他来写一写～

Jimmy · 发表于 2016-9-5 20:17:11

dulunar 发表于 2016-9-4 14:58
这个我师弟以前也搞过一段时间，他还自己写过一个比对的，我找个时间让他来写一写～ ...

O(∩_∩)O哈哈~好呀，支持支持

DXDGZW · 发表于 2023-1-7 03:50:30

非常感谢！

DXDGZW · 发表于 2023-1-14 05:52:13

非常感谢啊，不可多得的资料！

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[tutorial] bowtie算法原理探究