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[tutorial] bowtie算法原理探究

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发表于 2016-9-1 10:45:48 | 显示全部楼层 |阅读模式
这是我很久以前跟学生们一起仿写bowtie这个比对工具的部分功能的时候的记录,仿写经典工具能加深对数据处理本质的理解,也能促进生信菜鸟的入门过程,在这里大力推荐一下,当然,我的帖子你到不用细看,关键是要自己找的感兴趣而且也时候练手的项目,然后花点时间做下去。
http://www.bio-info-trainee.com/?s=bowtie

自己动手写bowtie第一讲:BWT算法详解并建立索引
自己动手写bowtie第二讲:优化索引
自己动手写bowtie第三讲:序列查询。
Bowtie 算法第四讲
Bowtie算法第五讲-index2tally
Bowtie算法第六讲-tally法对bwt索引进行搜索

当然,我的学习方法,并非就是最好的, 我只是分享一下,大家有什么想法的,可以在下面跟帖讨论

你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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发表于 2016-9-4 14:58:56 | 显示全部楼层
这个我师弟以前也搞过一段时间,他还自己写过一个比对的,我找个时间让他来写一写~
我的微博:dulunar
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 楼主| 发表于 2016-9-5 20:17:11 | 显示全部楼层
dulunar 发表于 2016-9-4 14:58
这个我师弟以前也搞过一段时间,他还自己写过一个比对的,我找个时间让他来写一写~ ...

O(∩_∩)O哈哈~好呀,支持支持
你这个问题很复杂,需要打赏,请点击 http://www.bio-info-trainee.com/donate 进行打赏,谢谢
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