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如何计算TCGA中非同义突变

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发表于 2018-5-31 14:42:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 为神武 于 2018-5-31 15:59 编辑

请大神指教:从TCGA数据库中把各种33种癌症类型的maf文件下载之后,我想计算一下TMB值,我看文献上说很多是挑选非同义突变来分析的,我看了一下maf文件中的突变类型很多,如何从maf文件中进行筛选非同义突变呢?看了很多文献,都没有具体的描述如何筛选的,是根据maf文件中的哪些信息可以挑选出非同义突变,请各位大神不吝赐教,先行谢过了!
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